Siden HIH i 2005 blev en afdeling af Aarhus Universitet, har afdelingen fået 4 millioner kr. årligt i erhvervsfremmemidler fra amterne og Region Midtjylland. Midlerne blev ydet på baggrund af en resultatkontrakt, som udløb den 31. december 2010. Region Midtjylland vil ikke genforhandle kontrakten, da det påpeges, at finansiering af universiteterne er en statslig opgave. Det er derfor afgørende, at man på anden vis sikrer, at der fortsat er økonomisk grundlag for at videreføre forskningen og understøtte den forskningsbaserede uddannelse på HIH.